Академическая гимназия Санкт-Петербургского государственного университета возникла в 1991 году на базе специализированной физико-математической и химико-биологической школы-интерната №45 при ЛГУ.
В настоящее время гимназия располагается на двух площадках - Васильевский остров и Старый Петергоф.
Базовыми учебно-научными подразделениями, определяющимии содержание обучения в Академической гимназии им. Д.К. Фаддеева СПбГУ, являются:
- биологический факультет
- институт наук о Земле
- математико-механический факультет
- физический факультет
- институт химии
- факультет прикладной математики - процессов управления
- институт истории
В гимназии живут и учатся школьники Ленинградской области, Северо-Западного региона и многих других городов и регионов России. Зачисление в гимназию осуществляется на конкурсной основе по результатам вступительных испытаний. Финансирование Академической гимназии им. Д.К. Фаддеева СПбГУ осуществляется за счет средств Федерального бюджета.