Санкт-Петербургский государственный университет гражданской авиации имеет в своём составе пять филиалов (в Бугуруслане, Красноярске, Выборге, Хабаровске, Якутске), два представительства (в Иркутске и Минеральных Водах), три института, шесть факультетов. Готовит специалистов по 12 специальностям и 20 специализациям.